MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 100402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019951	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
2	NC_019951	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629071
3	NC_019951	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
4	NC_019951	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
5	NC_019951	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629071
6	NC_019951	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
7	NC_019951	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
8	NC_019951	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	433629071
9	NC_019951	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
10	NC_019951	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
11	NC_019951	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
12	NC_019951	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629071
13	NC_019951	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	433629071
14	NC_019951	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
15	NC_019951	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	433629071
16	NC_019951	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	433629071
17	NC_019951	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	433629071
18	NC_019951	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629071
19	NC_019951	GACGTG	2	12	790	801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433629071
20	NC_019951	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
21	NC_019951	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433629071
22	NC_019951	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629071
23	NC_019951	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	433629071
24	NC_019951	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	433629071
25	NC_019951	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
26	NC_019951	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
27	NC_019951	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
28	NC_019951	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
29	NC_019951	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	433629071
30	NC_019951	TGATC	2	10	1200	1209	20 %	40 %	20 %	20 %	433629071
31	NC_019951	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629071
32	NC_019951	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
33	NC_019951	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	433629071
34	NC_019951	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
35	NC_019951	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	433629072
36	NC_019951	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	433629072
37	NC_019951	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	433629072
38	NC_019951	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433629072
39	NC_019951	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
40	NC_019951	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
41	NC_019951	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
42	NC_019951	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
43	NC_019951	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
44	NC_019951	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433629072
45	NC_019951	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	433629072
46	NC_019951	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
47	NC_019951	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
48	NC_019951	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629072
49	NC_019951	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629072
50	NC_019951	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
51	NC_019951	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629072
52	NC_019951	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	433629072
53	NC_019951	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
54	NC_019951	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433629072
55	NC_019951	ACCG	2	8	2846	2853	25 %	0 %	25 %	50 %	433629072
56	NC_019951	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	433629072
57	NC_019951	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629072
58	NC_019951	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	433629072
59	NC_019951	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629072
60	NC_019951	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	433629072
61	NC_019951	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629072
62	NC_019951	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	433629072
63	NC_019951	CGTC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	25 %	50 %	433629073
64	NC_019951	GGTA	2	8	3466	3473	25 %	25 %	50 %	0 %	433629073
65	NC_019951	GTG	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
66	NC_019951	ACG	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
67	NC_019951	CGC	2	6	3541	3546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
68	NC_019951	CAA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629073
69	NC_019951	TGT	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629073
70	NC_019951	GGTT	2	8	3648	3655	0 %	50 %	50 %	0 %	433629073
71	NC_019951	CGG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
72	NC_019951	GAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629073
73	NC_019951	TGG	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
74	NC_019951	CCGC	2	8	3876	3883	0 %	0 %	25 %	75 %	433629073
75	NC_019951	GAA	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629073
76	NC_019951	GGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
77	NC_019951	GGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
78	NC_019951	CGA	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
79	NC_019951	GCCA	2	8	4157	4164	25 %	0 %	25 %	50 %	433629073
80	NC_019951	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
81	NC_019951	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
82	NC_019951	GTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629073
83	NC_019951	CGA	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
84	NC_019951	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
85	NC_019951	CCG	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
86	NC_019951	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
87	NC_019951	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
88	NC_019951	TGC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629074
89	NC_019951	CG	5	10	4543	4552	0 %	0 %	50 %	50 %	433629074
90	NC_019951	CGTTG	2	10	4584	4593	0 %	40 %	40 %	20 %	433629074
91	NC_019951	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629074
92	NC_019951	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629074
93	NC_019951	CCA	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629074
94	NC_019951	ACG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629074
95	NC_019951	CGC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629074
96	NC_019951	CGG	2	6	4928	4933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629074
97	NC_019951	CG	3	6	4979	4984	0 %	0 %	50 %	50 %	433629074
98	NC_019951	AAG	2	6	5256	5261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629075
99	NC_019951	GGT	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
100	NC_019951	CGA	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
101	NC_019951	CGA	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
102	NC_019951	CCAC	2	8	5500	5507	25 %	0 %	0 %	75 %	433629075
103	NC_019951	ACCG	2	8	5519	5526	25 %	0 %	25 %	50 %	433629075
104	NC_019951	GTG	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
105	NC_019951	CGG	2	6	5555	5560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
106	NC_019951	TGG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
107	NC_019951	CGGCGT	2	12	5603	5614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433629075
108	NC_019951	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
109	NC_019951	CAAG	2	8	5714	5721	50 %	0 %	25 %	25 %	433629075
110	NC_019951	AAG	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629075
111	NC_019951	CGCC	2	8	5810	5817	0 %	0 %	25 %	75 %	433629075
112	NC_019951	CAA	2	6	5840	5845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629075
113	NC_019951	CGA	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
114	NC_019951	GTC	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629075
115	NC_019951	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
116	NC_019951	AGC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
117	NC_019951	GGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
118	NC_019951	GC	3	6	6205	6210	0 %	0 %	50 %	50 %	433629075
119	NC_019951	GGT	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
120	NC_019951	AAGGAC	2	12	6255	6266	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	433629075
121	NC_019951	GAC	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
122	NC_019951	AGACCA	2	12	6349	6360	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	433629075
123	NC_019951	GCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
124	NC_019951	CGGC	2	8	6625	6632	0 %	0 %	50 %	50 %	433629075
125	NC_019951	ATC	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433629075
126	NC_019951	GC	3	6	6711	6716	0 %	0 %	50 %	50 %	433629075
127	NC_019951	ATC	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433629075
128	NC_019951	ACG	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
129	NC_019951	TGT	2	6	6868	6873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629075
130	NC_019951	GTT	3	9	6878	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629075
131	NC_019951	CCG	2	6	6936	6941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629075
132	NC_019951	CTG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629075
133	NC_019951	GAA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629075
134	NC_019951	CAA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629075
135	NC_019951	ACC	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629075
136	NC_019951	GT	3	6	7132	7137	0 %	50 %	50 %	0 %	433629075
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249	NC_019951	CGA	2	6	13325	13330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629078
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261	NC_019951	GCG	2	6	13836	13841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629079
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384	NC_019951	GCACC	2	10	18968	18977	20 %	0 %	20 %	60 %	433629084
385	NC_019951	GCC	2	6	18992	18997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629084
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389	NC_019951	CCCG	2	8	19235	19242	0 %	0 %	25 %	75 %	433629084
390	NC_019951	CAA	2	6	19317	19322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629084
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392	NC_019951	GGT	2	6	19384	19389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629084
393	NC_019951	TCA	2	6	19390	19395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433629084
394	NC_019951	CGA	2	6	19483	19488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629084
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397	NC_019951	GTC	2	6	19645	19650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629085
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450	NC_019951	CG	4	8	22421	22428	0 %	0 %	50 %	50 %	433629092
451	NC_019951	CG	3	6	22448	22453	0 %	0 %	50 %	50 %	433629092
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464	NC_019951	GAG	2	6	23014	23019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433629093
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466	NC_019951	CTCA	2	8	23107	23114	25 %	25 %	0 %	50 %	433629093
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478	NC_019951	TGC	2	6	24355	24360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629095
479	NC_019951	CAA	2	6	24539	24544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629096
480	NC_019951	AAC	2	6	24690	24695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629096
481	NC_019951	ACCTTC	2	12	24723	24734	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	433629096
482	NC_019951	TTC	2	6	24771	24776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433629096
483	NC_019951	TGAT	2	8	24939	24946	25 %	50 %	25 %	0 %	433629097
484	NC_019951	GGCGT	2	10	24958	24967	0 %	20 %	60 %	20 %	433629097
485	NC_019951	TGCT	2	8	24986	24993	0 %	50 %	25 %	25 %	433629097
486	NC_019951	GCT	3	9	25000	25008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629097
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489	NC_019951	CCG	2	6	25045	25050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629097
490	NC_019951	ACC	2	6	25133	25138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629097
491	NC_019951	TC	3	6	25163	25168	0 %	50 %	0 %	50 %	433629097
492	NC_019951	GGC	2	6	25180	25185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629097
493	NC_019951	GCG	2	6	25192	25197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629097
494	NC_019951	CCG	2	6	25200	25205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629097
495	NC_019951	GGC	2	6	25219	25224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629097
496	NC_019951	GGGCC	2	10	25241	25250	0 %	0 %	60 %	40 %	433629097
497	NC_019951	TGG	2	6	25251	25256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629097
498	NC_019951	CG	3	6	25299	25304	0 %	0 %	50 %	50 %	433629097
499	NC_019951	CAT	2	6	25408	25413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433629097
500	NC_019951	TGC	2	6	25449	25454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629097

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